一日的风波果然如杨峥所料，他的逻辑学先在翰林院被人四处传说研究，然后短短一天的功夫，就传到了庙堂之上，那些言官平日里诵读就是朱程的理学长大，从而做官，对朱熹的理学可谓是奉为经典，哪里容得别人说三道四的，立即开始弹劾，这个说理为太极，是天地万物之理的总体，即总万理的那个理。
    “太极只是一个理字”。太极既包括万物之理，万物便可分别体现整个太极。这便是人人有一太极，物物有一太极。每一个人和物都以抽象的理作为它存在的根据，每一个人和物都具有完整的理，即“理一”。
    气是朱熹哲学体系中仅次于理的第二个范畴。它是形而下者，是有情、有状、有迹的；它具有凝聚、造作等特性。它是铸成万物的质料。天下万物都是理和质料相统一的产物。朱熹认为理和气的关系有主有次。理生气并寓于气中，理为主，为先，是第一性的，气为客，为属，为第二性，理就在这儿，无须什么逻辑学让世人明此真实之理，而于明悟为用，推论为梯。读之其旨似奥，而味之其理皆真，诚为格物穷理之大原本哉！认为杨峥的逻辑学是蛊惑之语，不应该让杨峥担任翰林院掌院一职。
    另一个则说理依气而生物，并从气展开了一分为二、动静不息的生物运动，
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