继弹劾山西总兵董一奎、浙江总兵刘显、英国公张溶、锦衣卫都督李隆等，除英国公张溶外，全部罢官。
    于是，在温如玉、欧阳一敬的弹劾奏报下，皇帝下旨，请令户兵二部破格发帑银马价以极匮济急，并选举废弃将官才勇可用者。兵部复具如二臣言。
    上曰地方失事重大，陈其学革任听勘，吏部急推相应者往代，毋绥，遴琥各住俸。督副总兵黄演等戴罪杀贼，废弃将官堪用者兵部具以名闻余悉如拟，于是增郭江左都督赐谥立祠，谕祭营葬具如张达例，荫一子世袭指挥佥事。发太仓银四万两，马价银二万两运赴该镇给用。已改刑部左侍郎霍冀为兵部左侍郎兼右佥都御史代陈其学；起原任巡抚宣府右佥都御史杨巍代替戴才。
    一个“儒缓”竟成罪名，这样，由刑部左侍郎霍冀代替陈其学接任了陕西总督，而宣府巡抚杨巍则代替了戴才出任陕西巡抚。
    公元1567年，明穆宗隆庆元年一月，陈其学六十岁时首次革任听勘。实际上，隆庆元年4月才追究嘉靖45年10月虏寇杀总兵郭江及杀千总高岚等14人的事，也才罢了陕西三边总督陈其学和陕西巡抚戴才的官，令其回籍听用。同时夺延绥巡抚王遴的奉禄；革了总兵官郭琥的职；守备高元吉等53人也纠治如律。
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