搜查的总部——公安的秘密基地里。铃木园子和家人被劝说去美国旅游，和京极真待在一起。少年侦探团的孩子和他们的父母，也被fbi以铃木财团的名义，邀请到了美国。
    玛丽不想让他人知道aptx-4869的秘密，和工藤夫妇一合计，动用两方的私人关系，在阿笠博士和真纯的掩护下，带着灰原哀和柯南一起去了国际刑警的基地。阿笠博士和灰原哀在那里的实验室里，昼夜不停地研究能让身体彻底恢复的解药，只有赤井秀一和工藤夫妇能联系到他们。
    “如果解药一直研究不出来，你们就一直待在那里吗？”赤井秀一问。
    “不会一直研究不出来的。”灰原哀说，“进度非常喜人。”
    “能让人变小的药物，和长生不老药只有一步之差，就像潘多拉的魔盒，绝不能被轻易打开。我们要死死守好这个秘密，不能让其他任何人知道。”玛丽说。
    “等解药完成，我就会把所有资料销毁。”灰原哀说，“但我们三个人本身，就是潘多拉的魔盒。”
    “我知道你在担心什么，”玛丽说，“你担心我们会因为这段特殊经历，被抓去做活体实验。”
    “没错，”灰原哀皱起眉，“比起被组织知道这个秘密，我更担心被政府知
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