军事则由都指挥使负责，三权分立，互相制约，巩固了朝廷中央的权力。
    然而在明朝后期，三司并立却演化成了彼此互相争功，却互相推诿责任的现象，没有一个强力的机构居中协调，三司的纷争反而造成了内耗，对朝廷的统治造成了负面影响。
    最终的解决办法就是在这三司之上，又加派了一名巡抚，官居正二品，总揽一省大权，所以如今山东，巡抚李懋芳最大，然后才是主管民政的从二品布政使张秉文，再往下，就是赵无忌这样的四品知府。
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