来，人类发现了莉莉丝的残躯，并获知了莉莉丝的计划，企图通过人类补完让全人类逆袭莉莉丝，获得永久生命的同时，也不再有任何隔阂，具体方法是通过类似妊辰的作用，让全人类的人类意识汇于一体，以莉莉丝为母体，诞生而出，取代莉莉丝掌握生命之树和黑之月，进行宇宙旅行。
    而这个计划的重点，就是人类补完计划的主导权。
    因此，人类效仿第十五颗生命之果的事件，从莉莉丝体内提炼出了智慧因子，并孕育出了绫波丽，同样也用生命之果和智慧之果的技术培育出了eva，而作为祭品的就是碇真嗣的母亲碇唯，碇唯的身体成为了智慧因子的载体，最终产生了无数绫波丽，而碇唯的灵魂则进入了eva，代替了本来需要牺牲一整个种族才能凝聚的种族意识。
    随后，所有生命之果的置换完成，并逐渐开始孵化，按照生命之树的规则，进行如同养蛊般的战斗，并寻找亚当。
    人类按照计划，成功战胜了所有使徒，并获得了与莉莉丝融合的权利。
    不过这时候，人类的劣根性便爆发了出来，魂之座每一个都想要成为人类补完计划的主体，于是培育搭载s2机关的量产机，袭击了nerV，不过碇原堂终究技高一筹，早在这之前就已经将亚当
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